本网讯 近日，Molecular Horticulture在线发表了安徽农业大学bet356体育在线官方网站刘永胜教授团队的研究论文，题为SSR2Marker: an integrated pipeline for identification of SSR markers within any two given genome-scale sequences。该研究报道了一个新开发的生物信息学工具SSR2Marker 。SSR2Marker可用于鉴定任何两组序列间潜在的SSR分子标记及其多态性特征。利用已有的高质量基因组序列，SSR2marker具有两方面的显著优势：SSR2Marker不仅考虑了SSR自身的序列长度差异，还考虑了SSR侧翼之间的序列长度差异，其分析结果更为准确，且能大大提升二态性SSR分子标记的数量；SSR2Marker利用两组序列中的相同片段作为模板来设计SSR分子标记的候选引物，理论上在两组序列中具有完全的通用性（Fig. 1）。

SSR2Marker是基于Perl语言开发的生物信息学工具，依赖BLAST、MAFFT、Primer3和e-PCR等程序，目前只适用于Linux或Unix平台环境。SSR2Marker的详细介绍及其使用方法见https://github.com/aaranyue/SSR2Marker。

该研究为SSR分子标记的筛选提供了新的思路和方法，其报道的SSR2Marker操作简便，使用灵活，可分析任何来源的DNA序列。同时，SSR2Marker提供的高质量SSR分子标记对高密度遗传图谱构建和全基因组分子设计育种具有重要的现实意义和应用价值。

安徽农业大学bet356体育在线官方网站岳俊阳副教授和刘永胜教授分别为论文的第一作者和通讯作者。该工作获得了安徽农业大学高层次人才启动经费、国家自然科学基金（31972474和90717110）等项目的资助。

文章链接：https://mp.weixin.qq.com/s/VBJ5q77MHVUTD7XPxwZliQ（通讯员：刘玉洁）